Posts

Showing posts from 2022

Note: Proteomic and Glycosylation Analysis of Biotherapeutic Proteins (hosted by -BRIC)

Image
Note: Proteomic and Glycosylation Analysis of Biotherapeutic Proteins Webinar hosted by : Bioprocess Research and Innovation Centre (BRIC) Application of mass spectrometry to Biopharma https://www.ema.europa.eu/en https://www.ema.europa.eu/en/human-regulatory/research-development/scientific-guidelines/biologicals/biologicals-active-substance#manufacture,-characterisation-and-control-of-the-active-substance-section ตัวอย่างที่เขายกมาคือ monoclonal antibody ก็คือ ต้องโชว์ว่าโคลนตัวนี้สามารถที่จะผลิต protein ที่เหมือนกับ genetic materials หรือเปล่า และแต่ละลอตมีปัญหาหรือเปล่า สิ่งที่เราอ่านก็คือ peptide map แล้วเอามาเทียบกันในแต่ละลอต IgG – glycosylated protein – glycan on the protein must be characterized, depending on the cell types you are using – glycosylation pattern is very different in each cell type. Heterogeneity มี micro and macro Micro ต่างกันที่ side chain นิดเดียว Macro ต่างกันที่ pattern ที่ไป glycosylate เลย ขึ้นอยู่กับว่าเราจะดีเทคแบบไหน วิธีดีเทคแต่ละแบบก็จะ consume เวลา ...

Note: chronochemotherapy

Image
- เอามาจาก the scientist - ร่างกายของคนเราปกติแล้วจะ align with external environment, esp. light, temperature หรือแม้กระทั่ง meals - ยกตัวอย่าง light เข้ามากระทบ retina ส่งสัญญาณไปที่ Suprachiasmatic Nucleus (SCN) ซึ่งเป็น core circadian clock ในร่างกายของเรา หลังจากนั้น core clock ก็จะส่งสัญญาณไปที่อวัยวะต่าง ๆ ให้ทำงาน align กัน เพื่อตอบสนอง light-dark cycle - การที่เรามีพฤติกรรมที่ ไม่สอดคล้องกับ biological clock ก็จะทำให้ร่างกายเรารวน และมีความเสี่ยงที่จะทำให้เกิดโรคต่าง ๆ ขึ้นได้ เช่น โรคนอนไม่หลับ หรือโรคที่เกี่ยวกับปัญหาการนอนหลับ โรคหลอดเลือดหัวใจ หลอดเลือดตีบ ความดันโลหิตสูง เบาหวาน หรือแม้กระทั่งโรคทางด้านจิตประสาท และมะเร็ง - เพราะการดำเนินชีวิตที่ไม่สอดคล้องกับ biological clock ทำให้ metabolism เราผิดเพี้ยนไปจากเดิม และรักษา homeostasis ได้ค่อนข้างยาก - ซึ่งจากหลักการข้างต้น ถ้าเรามีความเข้าใจว่าในแต่ละช่วงเวลา ร่างกายของเรามีการทำงานอย่างไร เราสามารถที่จะเลือกช่วงเวลาการใ้เคมีบำบัดอันจะส่งผลให้เกิดประสิทธิภาพสูงสุด และลดผลข้างเคียงลงได้ เพราะในแต่ละช่วงเวลาร่างกายมี me...

Note: How to wake up early, even if you are a night owl!

How to wake up early, even if you are a night owl! NPR - Life Kit : Health  Rerun episode:   Kavitha George – host of Alaska public media  – she is responsible for this episode of podcast in Life Kit (NPR) เริ่มด้วยคำถาม ทำไมการตื่นเช้าจึงน่าจะเป็นประโยชน์สำหรับคุณ – ซึ่งมันมีการศึกษาถึงความสัมพันธ์ระหว่างคนตื่นเช้า กับประสิทธิภาพต่าง ๆ เช่น เกรดที่ได้จากการเรียน การติดแอลกอฮอล์ ภาวะซึมเศร้า หรือการเกิดอุบัติเหตุเกี่ยวกับยานยนต์ จากการศึกษาพวกนี้ พบว่า คนที่เป็น morning person น่าจะมี potential ในการได้เกรดที่ดี ติดแอกอฮอล์ต่ำ ไม่ค่อยมีภาวะซึมเศร้า หรือแม้กระทั่งการเกิดอุบัติเหตุเกี่ยวกับยานยนตร์ก็ค่อนข้างน้อย มาแนะนำ อ. แพทย์ที่ทำงานทางด้าน Sleep medicine Dr. Katherine M. Sharkey  – Associate Professor of Psychiatry and Human Behavior at the Alpert Medical School of Brown University ซึ่งอธิบายได้ง่าย ๆ ถึงคำตอบต่อคำถามข้างต้นว่า คนที่เป็น night owl ส่วนใหญ่นั้นจะพักผ่อนไม่ค่อยเพียงพอ ทำให้ performance ไม่ค่อยดีเท่าที่ควร เมื่อเทียบกับคนที่เป็น morning lark Things t...

Note: Deciding When to Use PARP Inhibitors, and Which One

 บทความเก่า แต่เอามาเขียนสรุปสำหรับความเข้าใจตัวเอง https://www.ajmc.com/view/deciding-when-to-use-parp-inhibitors-and-which-one โดยรวม - เป็นเรื่องเกี่ยวกับการใช้ PARP1 inhibitor ว่าควรจะใช้เมื่อไหร่ ให้กับคนไข้ประเภทไหน และต้องข้อบ่งชี้อะไรบ้างก่อนที่จะให้ PARP1 inhibitor เพื่อให้เกิดประสิทธิภาพสูงสุด - โฟกัสมะเร็งรังไข่ - เนื่องจากตอนนี้มี PARP1 inhibitors อยู่ 3 ตัว ที่อยู่ในการทดลองระดับคลินิค 1.olaparib 2.rucaparib 3.niraparib - ยาทั้ง 3 ตัวมีโครงสรางทางเคมีต่างกัน และให้ประสิทธิผล และผลข้างเคียงที่ต่างกัน ดังนั้นจึงมีคำถามว่า 1. ควรให้ PARP1 แก่คนไข้ประเภทไหนดี 2.ควรจะให้เมื่อไหร่ 3.อะไรเป็นตัวบ่งชี้ (biomarkers) ว่าคนไข้คนนี้ควรจะได้รับ PARP1 และดูว่า PARP1 มีประสิทธิภาพในการรักษาแค่ไหน 4.ควรให้ PARP1 inhibitors ตัวไหน - การตัดสินใจว่าเมื่อไหร่จะใช้ PARP1 inhibitors -- ดูจากเรื่องการซ่อมแซมดีเอ็นเอของตัวเซลล์ - HR (homologous recombination) เป็นกระบวการหนึ่งในการซ่อมแซมดีเอ็นเอหักแบบสายคู่ (DNA double strand break repair) ซึ่งป้องกันเซลล์ปกติไม่ให้เกิดการกลายพันธุ์จนกระทั่ง...

Worldwide experimental platform

Image
 https://thewep.org/  (MCTQ) I know this from coursera:  Circadian clocks: how rhythms structure life Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU) The course was conducted by two professors: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=Roenneberg+T&cauthor_id=26196479 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=Merrow+M&cauthor_id=34816105 The course goes from the big picture to the molecular level. Learning the new terms related to chronobiology. 

AKI and leaky gut theory (MS reading)

Image

Note: PARP1i and ATRi combination in TK6 model (reading MS)

Image

Publication fee (update)

Image
 แปะไว้กันลืม

Mixed Method Research

Image
 Mixed Method Research -- introduced by SHEE - Faculty of Medicine, Siriraj Hospital 1. Lecturer is very well-explained. 2. I used this method to do the research and realized later it is called mixed method research. 3. It contains both qualitative and quantitative. 4. The research which I have done previously and I think we used mixed method:  Chitphuk, S.; Stitchantrakul, W.; Ongphiphadhanakul, Boonsong; Kueanjinda, P.; Lerksuthirat, T.** Public perceptions on Twitter about COVID-19 vaccines in Thailand. The Southeast Asian Journal of Tropical Medicine and Public Health 2022, 53, url: https://journal.seameotropmednetwork.org/index.php/jtropmed/article/view/618 Note:

Genomics Thailand (Day 2)

Image
 

Genomics Thailand (Day 4)

Image
 Online tools and databases Biomart -- python search " https://github.com/search?l=Python&q=biomart&type=Repositories "

IESA-BIS (business incubator school)

ไม่รู้เลยว่า CEO ของ Dentiste เปิดมหาวิทยาลัย IESA เพื่อสอนให้คนสามารถทำธุรกิจเป็น (หลักสูตร BIS ) ฟังดูแนวคิดแล้วเข้าท่าดี เหมาะกับยุคปัจจุบัน ที่การเป็นลูกจ้างองค์กรในบางตำแหน่งนั้นอัตราการแข่งขันสูง ชอบไอเดียที่ให้ทำ 80% แล้วอีก 20% เอามาจับกับทฤษฎีที่มีอยู่ เพราะสุดท้ายผู้เรียนก็ต้องเอาตัวรอดเป็น ทำมาหากินได้ด้วยตัวเอง และเสียภาษีให้กับระบบ เพื่อให้สังคมโดยรวมมันเดินไปได้ ถ้าหลักสูตรมหาวิทยาลัย เปิดมาแล้ว ผู้เรียนจบแล้ว หางานยากมาก หรือไม่ได้สอนทักษะในการหาเงิน เราว่าหลักสูตรแบบนี้ควรต้องปรับปรุง การที่ผู้เรียนว่างงาน มันเท่ากับว่าสูญเสียทรัพยากรไปเหมือนกัน และในลักษณะเดียวกัน ก็ต้องมีสภาพแวดล้อมที่ต้องทำให้เกิดการเจริญเติบโตทางเศรษฐกิจ ไม่งั้นแล้ว จำนวนงานมันน้อยลงแน่นอน หรือคนไม่มีกำลังจะซื้อของเพื่อแลกเปลี่ยนมูลค่ากัน  แต่อีกมุมหนึ่ง ตัวผู้เรียน ก็ต้องมีความพร้อมที่จะทำด้วย ตามคอนเซปเขาเลย ททท ทำทันที ถ้าคนที่มาเรียน มาเอาแต่นั่งเรียน แต่ไม่ลงมือทำ ก็จบเลย -- ดังนั้น เขาคัดผู้เรียน ปล. ไม่แน่ใจว่าค่าเรียนเท่าไหร่นะ

Genomics Thailand (Day 3)

Image

Genomics Thailand (Day 1)

Image
  The talk was from Dr. Sissades Tongsima , very inspired though - he talked about how he relearned things. I have never known he is an industral engineer not the computer engineer. Recent progress update:  https://www.tshg.or.th/forum/kh-muulokhrngkaarcchiionmikspraethsaithy/raayngaankhwaamkaawhnaapracchameduue-nkh-ngokhrngkaar-genomics-thailand-r-beduue-nkanyaayn-65

Circadian Medicine -- quality of life depending on understanding our biological clock

Image
 

Note: Medical Cannabis

Image
 

APCO - value stock? issue with health claim

Image
บังเอิญว่าเห็นแอดใน FB เยอะมากเลยมาดูหน่อยว่ามันเกี่ยวข้องกับ T-cell ยังไงบ้าง ค้นไปค้นมา เพิ่งรู้ว่า บ.นี้ อยู่ในตลาดหลักทรัพย์ด้วยภายใต้ชื่อ APCO ลองดู Oppday/Q1 ดูแล้วเหมือนธุรกิจทำกำไรจากการขายแบบบอกต่อ ๆ กัน เป็นบริษัทที่ทำเกี่ยวกับอาหารเสริมเท่านั้น แต่ดูจากวีดีโอเหมือนมีฤทธิ์คล้ายยาเลย แต่พอไปค้นดู literatures ที่เกี่ยวข้องกลับพบว่า clinical trials เกี่ยวข้องกับเคลมไม่มีเลย ถ้าเซิร์ชผ่านชื่อของ ประธาน บ. ถ้าดูใน Oppday แล้ว หลักการทางวิชาการ แทบไม่มีความชัดเจนเลย และไม่มี logical flow (weak evidence-based) และถ้าไปดู ผลงานวิจัยและพัฒนา ในเว็บของ APCO เอง ก็ตกใจเข้าไปใหญ่เมื่อข้อมูลเป็นข้อมูลที่ไม่ได้ผ่านการพิจารณาจาก วารสารทางวิชาการระดับนานาชาติ เลยไม่แน่ใจว่าหุ้นตัวนี้จะสามารถเป็น value stock ได้หรือเปล่า Oppday/Q1 -- APCO บทสัมภาษณ์ของ CEO ใน optimise ของเกียรตินาคิน ดูแล้วมีวิสัยทัศน์ และมีความมุ่งมั่นดี แต่ลักษณะการเคลมถึงประสิทธิผล ควรจะต้องมีการทดลองระดับคลินิคด้วย ไม่งั้นแล้วความน่าเชื่อถือน้อยมาก ลองมาดูบทสัมภาษณ์ของ อ. เขาใน perspective -- ดูมี passion ดี -- แต่แกย...

Food safety by SciSpec seminar

Image

Lessons from Dr.Yui -- Perspective interview

Image
 what I have learnt (creative writing mode - no grammar) - risk is reduced when you know what is it and what is for. - text books teaching you in the academic do not inform you everything, learning by doing in real-life will extend your knowledge and becoming personal experiences. - sticking with business that entering a growth curve, there will be a demand for the products. it will be much easier to do the business. to growth exponentially during the S-curve, better to enter capital (stock market to obtain the funding from mass). obtaining mass funding -- > the ability to build mass products and reduce the cost of construction - she studies from the success company and found that those company had the strategic partner to accelerate the path of success - to find a good strategic partner, mindset must be on the same way. otherwise, it could not get along in long run. what is their philosophy? whether it correlates to ours? - there is no 100% fairness. that was she believed - gi...

ISO 5058-1:2021(en) Biotechnology — Genome editing

Image
ไม่นึกว่าจะมี standard ในเรื่องการกำหนดคำที่ใช้ในงานตัดแต่งพันธุกรรม เอามาแปะไว้ เผื่อหาทางดาวน์โหลดต้นฉบับได้ เนื่องจากเทคโนโลยีนี้กำลังอยู่ในงานวิจัยทางคลินิคหลาย ๆ งาน และเพื่อป้องกันความสับสนเขาเลยตั้งมาตรฐานในการใช้คำต่าง ๆ เพื่อให้สื่อสารได้อย่างเข้าใจตรงกัน https://www.iso.org/obp/ui/#iso:std:iso:5058:-1:ed-1:v1:en

Ethic case for using social media information for research

Image
 https://sp.mahidol.ac.th/th/Intro-Researcher/(4-2-65)-final-social-media-research-penchan-edited.pdf

Statistic for genomic data science

สถิติ ช่วยอะไรได้บ้าง 1. เอามาใช้ในการสุ่มเลือกกลุ่มประชากร เพื่อใช้ได้การศึกษา ซึ่งต้องดูว่าจะสุ่มเลือกตัวอย่างแบบไหน 2. การสุ่มเลือกที่ดี คือ ต้องสามารถเอามาเป็นตัวแทนของข้อมูลที่ถูกสุ่มมาได้เป็นอย่างดี 3. สถิติยังช่วยในเรื่องของการอธิบายลักษณะของกลุ่มประชากรที่ถูกสุ่มมา จากการเรียนรู้ผ่านทางกลุ่มตัวอย่าง

English levels -- Reading

Image
Source: https://www.efset.org/english-score/ Source:  https://www.ets.org/s/toefl_itp/pdf/38781-TOEFL-itp-flyer_Level1_HR.pdf Marking for myself -- Mine would be categorized as B2, but I would like to improve to C1-2. The university sets a TOEIC score level of at least 400 to recruit staff, but I seriously think it is too low for the academic environment. TOEIC was 775 (listening 455, reading 320) - 2007-04-21 TOEFL-ITP was 533 (listening 55, structure + written 47, reading 58) - 2009-12-12 IELTS was 6.0 (listening 5.5, reading 6.5, writing 5.5, speaking 6.5) - 2014-05-17 TOEIC was 900 (listening 470, reading 430) - 2016-05-16

ทุนยุทธศาสตร์วิจัย มม.

Image
สรุป -- สำหรับ อ./นักวิจัยรุ่นใหม่ speed ในการทำงาน acadmic ถูกกระทบจาก การจัดการ (เช่น เรื่องเอกสารต่าง ๆ) และ ระบบสนับสนุนต่าง ๆ (เช่น ค่าตีพิมพ์ เครื่องมือ และ manpower) --    1. มหาวิทยาลัยใช้ ranking เพื่อเอามาเป็นไม้บรรรทัดวัดตัวเอง 2. การที่จะได้อันดับสูงขึ้น citation มีความสำคัญมากกว่าจำนวนการตีพิมพ์ และ impact มีผลมากกว่าจำนวนการตีพิมพ์ 3. ยิ่งตีพิมพ์ใน Q1 จะทำให้ได้ จน. การอ้างอิงค่อนข้างเยอะ และถ้าต้องการบูสเพิ่มไปอีก คือ ต้องอยู่ใน T1 ของ Q1 4. AXISS -- > กองบริหารงานวิจัยจะเริ่มใช้เกณฑ์นี้เป็นตัวจับเรื่องทิศทางการขอทุน - A -- Advanced research -- เป็นงานวิจัยขั้นสูง - X -- field / Corporate Collaboration -- มีการร่วมมือกันในหลากหลายสาขาความเชี่ยวชาญ - I -- internationl collaboration -- มีการร่วมมือระหว่างนานาชาติ - I -- innovation -- มีนวัตกรรมที่ส่งผลเชิงบวกต่อสังคม - SDGs -- related research -- comply with 17 SDGs 5. PREP จะมีการอบรมอาจารย์ใหม่ ๆ เพื่อส่งเสริมประสิทธิภาพให้ดีขึ้น และจะมีตลอดปี 6. @MUREX line -- > fastest way to communicate the research fu...