Note: APPTEST is an innovative new method for the automatic prediction of peptide tertiary
Note: APPTEST is an innovative new method for the automatic prediction of peptide tertiary Structures_2021 Preprint doi: 10.1101/2021.03.09.434600 APPTEST ~ using Neural network Simulated annealing Work on both linear and cyclic peptides 5-40 AA https://research.timmons.eu/apptest Peptide Less likely to accumulate in tissues (short half-life) Less susceptible to development of drug resistance Cost-effective to produce ตลกดีเหมือนกันที่เปเปอร์ยกตัวอย่าง anti-fusion of HIV ~ enfuvirtide แต่พอไปเซิร์ชหาข้อมูลจริง ๆ แล้ว ยาตัวนี้ผลิตยากมาก และแพง แสดงว่าการที่ generalize ว่า peptide สร้างง่าย ราคาถูก ไม่น่าจะจริง ใจจริงอยากเห็นการปิดแก็ปตรงนี้ ซึ่งบิษัทเอกชนทำได้ดี เพราะคิดเรื่องการลงทุนเป็นหลัก แต่ academic จะเน้นแค่ตีพิมพ์ออกมา ไม่ค่อย realistic .. Available software to predict tertiary structure; I-TASSER , -- เคยใช้ตอนช่วยเขียนเป rare genetic disease Rosetta , HHpred , NovaFold , AlphaFold 2 Tertiary prediction of peptides; PEPstr PEPstrMOD -- include cy...