Posts

Showing posts with the label chatGPT

ChatGPT -- DataCamp learning

Image
Note from DataCamp on Introduction to ChatGPT -         ChatGPT is generative AI, which is a subset of ML (ML is a subset of AI). Artificial intelligence Machine Learning Generative AI -         It generates the new contents by using patterns in the information that it has learned before (a large language model). -         What does it do? -         Prompt (question, asking, request, action) – input -         Throw it at the large language model (LLM) -         LLM uses a complex algorithm to determine the pattern and structure and create the response (generative) -         Create a response as output -    ...

Ways to reduce technical variation

Result -- (Asking through ChatGPT and ACP meeting with Dr.Somchai and Dr.Wararat) โดยปกติแล้วจะมี variation อยู่ 2 อย่าง คือ Biological  variation -- ไม่สามารถปรับเปลียนได้ ต้องอธิบายว่าเกิดจากอะไร Technical variation สามารถที่จะลดลงได้ จากการ normalization (data preprocessing) ซึ่งการ normalization ส่งผลให้เราสามารถเปรียบเทียบผลการทดลองที่มาจาก sample แตกต่างกันได้ รวมไปถึงผลที่มาจากคนละ experiment จะใช้วิธีไหน ก็ขึ้นอยู่กับลักษณะของการออกแบบการทดลอง ลักาณะของข้อมูล และ เป้าหมายของงานวิจัย วิธีการ normalization สามารถเอามาพิจารณาร่วมกันได้ เพื่อนำเอามาแปลผลการทดลอง ซึ่งทำได้อยู่หลายวิธีใน proteomics Total protein normalization เอาค่า peptide/protein ทั้งหมดมาหาร โดยตั้งสมมุติฐานว่า แต่ละแซมเปิลมี major protein contents ในจำนวนเท่า ๆ กัน (It assumes that the majority of proteins are not differentially expressed and that the total protein content remains relatively constant across samples.) Internal standard normalization know quantity of an internal standard จะถูกเติมเข้าไปในแซมเปิ...