Random Records

Note: A path to efficient gene editing Doi: 10.1038/s41591-018-0110-y Gene editing in human pluripotent stem cells (hPSCs) and iPSC -- the efficiency is very low compared to the other cell types. Kaykas and colleagues and Taipale and colleagues finding p53 antagonizing efficient genome editing using Cas9 in hPSC and immortalized human retinal pigment epithelial cells Editing gene that is silent in hPSCs -- > same result as editing one that active Single DSB induced by Cas9 in the genome of hPSC -- > reduces their survival Cas9 screens in transformed cells Copy number of gene target (rather than nature of individual genes) -- > drive phenotype of edited cells Thus -- clinical applications -- this could cause undesired side effects Kaykas and colleagues  Study transcriptional response of hPSC using gene editing with Cas9 Even one single strand break -- > increases expression of genes involved in programmed cell death Cas9-induced toxicity is mediated by p53 Reduced the le...

เทคโนโลยีการตัดแต่งจีโนม (Genome editing technology) เป็นเทคโนโลยีที่อาศัยการกระตุ้นของการเกิด DNA double strand break แล้วเหนี่ยวนำให้เกิดกระบวนการซ่อมแซม DNA อันจะมีอยู่ 2 วีธีหลัก คือ  1. Homologous recombination (HR) ซึ่งต้องการ template ในการที่จะซ่อมแซมความเสียหายที่เกิดขึ้น ผลจากการซ่อมแซมดังกล่าวจะทำให้ได้สายของสารพันธุกรรมกลับมาเป็นอย่างเดิม (error-free) 2. Non-homologous end-joining (NHEJ) เป็นการซ่อมแซมแบบต่อสายของ DNA ที่ขาดเข้าโดยตรง ซึ่งกระบวนการต่อนั้นโดยปกติแล้วจะมีการเพิ่ม หรือการเติมของสารพันธุกรรมกลับเข้าไปในบริเวณที่เกิด DNA double strand break นอกเหนือไปจากนี้แล้ว อาจจะทำให้เกิดการ translocation ของตัว genome อันเนื่องมาจากการต่อกันที่ผิดของตัวแท่งโครโมโซม ดังนั้นแล้ววิธีการซ่อมแซมดังกล่าวส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของ genome (error-prone) ณ ตอนนี้เทคโนโลยีที่มีการกล่าวถึงมากที่สุด คือ Zinc finger, TALENs และ CRISPR/Cas ซึ่งถือว่าเป็นเทคโนโลยีสมัยใหม่ในการตัดแต่งจีโนม เทคโนโลยีทั้งสามดังกล่าวจะเกี่ยวข้องกับการทำให้เกิด DNA double strand break ก่อนโดยอาศ...