Note: From Computation to Clinic - Drug Discovery, Function, and Delivery Innovations

เข้าเฉพาะแค่ lecture

สไลด์ข้างล่างถ่ายมาเพื่อเก็บเป็นข้อมูลว่า เขาบริหารจัดการเรื่องศูนย์ต่าง ๆ อย่างไรบ้าง ในมหาวิทยาลัยเดียวกัน เพื่อให้การทำงานในเชิงเภสัชวิทยาครบลูป คือตั้งแต่หา target ไปถึงออกเป็น clinical study มีความชัดเจนพอสมควร ว่าใครเกี่ยวข้องตรงไหนในเฟสต่าง ๆ และจะมีการทำงานต่อเนื่องกัน

สรุปคร่าวที่สนใจ

- เลือก pdb ให้ถูกตัวเพื่อที่จะเอามา docking เพราะมีหลายไฟล์ และ resulution ก็ไม่เหมือนกัน วิธีที่ได้มาก็ไม่เหมือนกัน

- เลือก accurate docking และ scoring algorithm ตรงนี้มีความสำคัญต่อการ docking

- สารตัวไหนที่ต้องการสกรีน

- GPU ที่เราจะใช้ มีความสำคัญในเรื่องความเร็ว

- ตัว hit มีกี่ตัว

- Docking ค่อนข้าง solid เพราะอิงจาก 1 snapshot ของโครงสร้างโปรตีน แต่ Molecular dynamics จะให้ protein มันขยับเขยื้อนได้

- การหา Candidate -- low binding enegy และ low flexibility -- หมายถึงจับได้แน่นไม่หลุด