Posts

Showing posts from March, 2021

Note: Protecting the aging genome

Image
มาดู theme ของการเข้าสู่สังคมผู้สูงวัย Note: Protecting the aging genome doi: 10.1016/j.tcb.2019.12.001 Three main layers protect the accumulation of DNA damage Reducing damaging molecules (antioxidant) Repairing DNA damage Inducing senescence/apoptosis to response to persistent DNA damage The end of this paper -- help to propose novel interventions which increase healthspan!! DNA repair is quite conserved and important for living organisms as stated above. Markers of DNA damage - observe in age-associated disease Obvious evident -- ppl who has defective in DNA repair -- show features of premature or accelerated aging Defect in different pw --aging features in different tissues; Cockayne syndrome, ataxia-telangiectasia -- premature neurological aging Werner syndrome, Hutchinson-Gilford progeria -- cardiovascular aging >50 DNA repair disorders described with various degrees of overlapping phenotypes with aging -- > suggest different types of DNA damage -- > different pathologie...

SDG - sustainable development goals

Image
Update: 31-Mar-2021 เห็นว่า Elsevier มี ก็เลยลองคิดจะทำบาง จะปรับเปลี่ยนพฤติกรรมตัวเองยังไงให้สอดคล้องกับเป้าหมายการพัฒนาอย่างยั่งยืน ตามคอนเซปของ UN ที่ประเทศไทยได้เป็นหนึ่งในสมาชิกของสหประชาชาติ นอกเหนือไปจากนี้แล้ว มหาวิทยาลัย และหน่วยงานภายใต้สังกัด ก็ชูคอนเซปนี้เพื่อที่จะทำให้เกิดความเป็น globalization และทำให้เกิดการพัฒนาได้อย่างยั่งยืน (ทำได้จริง ไม่จริง อีกเรื่องนะ) พอไปหาข้อมูลเพิ่มเติม เอาเข้าจริงแล้ว  The Times Higher Education ได้เซต criteria ว่าถ้ามหาวิทยาลัยสามารถทำตาม goals พวกนี้ ลำดับก็จะได้สูงขึ้น มิน่าหล่ะ เห็นแต่ละหน่วยงานพยายามฟิตกิจกรรมเข้ากับ goals ต่าง ๆ ของ SDG ~ https://www.timeshighereducation.com/impact-rankings-2020-methodology เลยไปก็อปลิงค์มา เอามาดูขำ ๆ (สามารถ click เพื่อดูรายละเอียดได้เลย เขากำหนดเลย) SDG 1 – no poverty SDG 2 – zero hunger SDG 3 – good health and well-being SDG 4 – quality education SDG 5 – gender equality SDG 6 – clean water and sanitation SDG 7 – affordable and clean energy SDG 8 – decent work and economic growth SDG 9 – industr...

Note: APPTEST is an innovative new method for the automatic prediction of peptide tertiary

  Note: APPTEST is an innovative new method for the automatic prediction of peptide tertiary Structures_2021 Preprint doi: 10.1101/2021.03.09.434600 APPTEST ~ using  Neural network Simulated annealing Work on both linear and cyclic peptides 5-40 AA https://research.timmons.eu/apptest Peptide Less likely to accumulate in tissues (short half-life) Less susceptible to development of drug resistance Cost-effective to produce ตลกดีเหมือนกันที่เปเปอร์ยกตัวอย่าง anti-fusion of HIV ~ enfuvirtide แต่พอไปเซิร์ชหาข้อมูลจริง ๆ แล้ว ยาตัวนี้ผลิตยากมาก และแพง แสดงว่าการที่ generalize ว่า peptide สร้างง่าย ราคาถูก ไม่น่าจะจริง ใจจริงอยากเห็นการปิดแก็ปตรงนี้ ซึ่งบิษัทเอกชนทำได้ดี เพราะคิดเรื่องการลงทุนเป็นหลัก แต่ academic จะเน้นแค่ตีพิมพ์ออกมา ไม่ค่อย realistic ..  Available software to predict tertiary structure; I-TASSER , -- เคยใช้ตอนช่วยเขียนเป rare genetic disease Rosetta ,  HHpred ,  NovaFold , AlphaFold 2 Tertiary prediction of peptides; PEPstr PEPstrMOD -- include cy...